主要根据临床表现，但应注意患者在出现皮疹前可有数月或数年的局限性阴囊瘙痒或烧灼病史。对久治不愈的阴囊湿疹、皮炎、溃疡，医师应充分警惕阴囊癌的可能性，局部组织病理活检是最有力的诊断。有可疑亦应进行B超、CT、MRI及细针穿刺活检等帮助诊断明确分期。

阴囊癌的早期诊断和早期治疗很重要，早期尽力争取手术切除，如Mohs化学外科切除，即在显微镜下连续观察被切除的癌组织，直到肿瘤完全切除干净。对于切除范围过广包蔽阴囊内容物困难者，可采用皮瓣转移及阴囊成形术，阴囊内容物已受累者则应一并切除。手术后可例行或对切除不彻底者、不宜行清除术者加用深度X线做放射治疗，必要时可做化疗，但常常欠敏感。阴囊癌晚期有内脏或远处转移者，亦可用放化疗做姑息性辅助治疗，局部切除后亦可用这些治疗来预防复发。

根据病理类型不同而有差异，阴囊鳞状细胞癌若早期获得诊断治疗又无淋巴结转移者，5年生存率可达50%以上，手术时临床分期已属于III期或治疗时有较多淋巴结转移者5年生存率往往低于25%。阴囊炎性细胞癌病变局限于表皮者预后较佳，真皮及淋巴被侵犯者，治疗后存活很少超过5年。

改善工作环境，避免致癌物质的侵害，局部保持清洁，可避免或减少阴囊癌的发生。