1、真菌性角膜炎主要是抗真菌治疗,包括局部的滴抗真菌的眼药水(那他霉素滴眼液、0.25%二性霉素B眼药水、0.5%咪康唑眼药水、0.15%二性霉素B眼药水等),或结膜下注射抗真菌的药物,同时还有抗真菌的眼膏也可以使用,一般很少全身应用抗真菌的药物治疗,因为它对肝脏的损害比较大,同时还可以采用辅助的药物治疗(.并发虹膜睫状体炎者,应使用1%阿托品眼药水或眼膏散瞳。),如果发现及时、治疗及时,一般能达到不错的治疗效果,但是还要注意预防,以免再次复发。
2、手术治疗:即使诊断明确,用药及时,但仍有15-27%患者病情不能控制,此时需考虑手术治疗,包括清创术、结膜瓣遮盖术和角膜移植术。